يتكون الهيكل التنظيمي للمعهد من الوحدات التالية:

مجلس الادارة

يتكون مجلس الادارة من:

-الرئيس أو من ينوبه-

-مدير المعهد التربوي للتكوين-

-م-دير ادرة التكوين المهنى فى الوزارة الوصية

-مدير ادارة التعليم الحر فى الوزارة الوصية-

-ممثل عن ارباب العمل الموريتانيين-

-رئيس نقابة التكوين المهنى-

-رئيس نقابة مؤسسات التعليم الحر-

الادارة

المدير-

مسئول الشئون الإدارية والمالية- .

مسئول الإعداد و التدريب-

مسئول البحث العلمى والاستشارات-
-مسئول الإعلام والاتصال-

عدد غير ثابت من الموظفين المدربين المؤقتين حسب الحاجة-