يتكون الهيكل التنظيمي للمعهد من الوحدات التالية:
مجلس الادارة
يتكون مجلس الادارة من:
-الرئيس أو من ينوبه-
-مدير المعهد التربوي للتكوين-
-م-دير ادرة التكوين المهنى فى الوزارة الوصية
-مدير ادارة التعليم الحر فى الوزارة الوصية-
-ممثل عن ارباب العمل الموريتانيين-
-رئيس نقابة التكوين المهنى-
-رئيس نقابة مؤسسات التعليم الحر-
الادارة
المدير-
مسئول الشئون الإدارية والمالية- .
مسئول الإعداد و التدريب-
مسئول البحث العلمى والاستشارات-
-مسئول الإعلام والاتصال-
عدد غير ثابت من الموظفين المدربين المؤقتين حسب الحاجة-